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扩增子测序检测
检测咨询量:1位   发布时间:2026-05-30 18:36:11   更新时间:2026-05-30 19:11:32   
第三方扩增子测序检测机构北检检测可承接16S rRNA扩增子测序、18S rRNA扩增子测序、ITS扩增子测序、微生物多样性测序、肠道菌群检测、土壤微生物群落检测、水体环境微生物检测等扩增子测序检测,北检(北京)检测技术研究院按照扩增子测序检测标准对扩增子测序进行检测分析,7-15个工作日由北检研究院出具扩增子测序检测报告。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望见谅。

检测信息(部分)

问:什么是扩增子测序?

答:扩增子测序是一种针对特定区域进行PCR扩增后进行高通量测序的技术。该方法通过设计特异性引物,对目标基因区域进行扩增,结合高通量测序平台对扩增产物进行序列测定,从而分析该区域内的物种组成、多样性或基因变异情况。

问:扩增子测序主要应用于哪些领域?

答:扩增子测序应用领域较为广泛,涵盖了微生物群落结构分析、环境微生物检测、食品安全微生物监测、人体肠道菌群研究、土壤微生态分析以及动植物系统发育研究等多个方面。

问:扩增子测序的检测流程概要是怎样的?

答:检测流程通常包括样本接收与预处理、基因组DNA提取与质检、特异性引物设计与PCR扩增、扩增产物纯化、文库构建与质控、上机测序以及后续的生物信息学数据分析与报告生成。

问:该检测服务可以为客户提供哪些数据结果?

答:服务通常提供原始测序数据、质控后的有效数据、OTU/ASV聚类结果、物种分类注释信息、多样性分析结果(包括Alpha多样性和Beta多样性)、物种组成丰度表以及差异物种分析等图表与报告。

检测项目(部分)

  • Alpha多样性指数:反映样本内物种的丰富度和均匀度。
  • Beta多样性分析:用于比较不同样本间群落结构的差异。
  • 物种注释与分类:确定测序序列对应的物种分类学信息。
  • OTU聚类分析:将相似序列归类为操作分类单元。
  • ASV分析:以精确序列变体为单位进行特征分析。
  • 物种丰度heatmap图:以热图形式展示各样本物种相对丰度。
  • 主成分分析(PCA):通过降维分析展示样本间的相似性。
  • 主坐标分析(PCoA):基于距离矩阵进行样本关系的可视化。
  • UPGMA聚类分析:基于物种距离构建聚类树展示样本层级关系。
  • Venn图分析:展示不同分组间共有或特有的OTU或物种。
  • LEfSe差异分析:寻找组间具有统计学差异的生物标记物。
  • 组间差异检验:通过统计学方法比较组间物种丰度差异。
  • 群落构建分析:解析微生物群落构建过程中的主要生态过程。
  • 网络分析:探究物种间的共现或互斥关系。
  • 功能预测:基于物种组成预测微生物群落的代谢功能。
  • 稀有曲线分析:评估测序深度是否覆盖样本中的物种。
  • 物种累积曲线:用于评估样本量是否足以反映群落特征。
  • 样本层级聚类:基于Bray-Curtis等距离进行样本聚类。
  • RDA/CCA分析:通过环境因子解释物种分布变异。
  • 相关性热图:分析环境因子与物种间的相关性。
  • PCoA在三维空间的展示:立体呈现样本间的分布关系。
  • 物种组成堆叠柱状图:直观展示各分类水平下的物种构成。

检测范围(部分)

  • 16S rRNA扩增子测序
  • 18S rRNA扩增子测序
  • ITS扩增子测序
  • 微生物多样性测序
  • 肠道菌群检测
  • 土壤微生物群落检测
  • 水体环境微生物检测
  • 空气微生物检测
  • 活性污泥微生物检测
  • 发酵食品微生物检测
  • 口腔微生物组检测
  • 皮肤微生物组检测
  • 生殖道微生物检测
  • 植物内生菌检测
  • 根系微生物检测
  • 海洋微生物多样性检测
  • 极端环境微生物检测
  • 甲烷菌特异性扩增子检测
  • 固氮菌特异性扩增子检测
  • 功能基因扩增子测序

检测仪器(部分)

  • Illumina NovaSeq测序仪
  • Illumina MiSeq测序仪
  • ABI 3730xl测序仪
  • QuantStudio荧光定量PCR仪
  • Bio-Rad T100 PCR仪
  • NanoDrop分光光度计
  • Agilent 2100生物分析仪
  • Qubit荧光计
  • 电泳仪及成像系统
  • 高速冷冻离心机
  • 超低温冰箱
  • 恒温培养箱

检测总结

综上所述,扩增子测序作为一种成熟且高效的分子生物学检测手段,能够通过针对特定基因区域的深度测序,准确解析样本中的微生物群落结构及多样性信息。本机构提供的扩增子测序服务,依托标准化的实验流程和专业的生信分析团队,致力于为科研院所、医疗机构及相关企业提供客观、详实的检测数据支持。通过多维度、多层次的指标分析,该服务有助于客户深入探究微生物与环境或宿主之间的相互关系,为后续的研究与应用提供科学依据。

常见问题

北检院检测周期一般为7-15工作日,具体周期需要根据样品情况来定。请您在咨询时尽可能的描述样品的情况以及样品状态,由此可制定更好的检测周期和检测方案。

为了防止在制样时对样品产生部分变化,导致检测数据有偏差,检测样品一般为客户提供,如果客户实在无法制作检测样品,则由北检院进行样品的制作。

检测方案可以根据客户检测需求来制定,如果客户要求相应的检测方案则按照客户提供的检测方案进行检测,如客户没有检测方案,则工程师通过检测标准进行制定,如果是非标试验,则由工程师根据样品信息对方案进行制定。

检测流程

检测流程

检测流程

检测优势

1、单位面向科研院所、学校和社会企业及科研单位,面向社会公共服务。

2、实验管理中心下设检测分析中心、科研测试中心、X射线应用中心。

3、面向物理、化学化工、材料、纳米、环境、电子、能源等众多学科。

4、拥有多台精密检测仪器设备。

5、能够从事材料微观结构分析、定性和定量分析、材料性能测定、材料质量综合评定等工作。

6、提供24小时开放服务、网络化的管理。

7、具备向校内外科学研究和品质鉴定提供公正、科研测试数据能力的重要机构。

检测实验室

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第三方蛋白芯片检测机构北检检测可承接细胞因子抗体芯片、信号通路分析芯片、肿瘤标志物筛查芯片、自身免疫抗体芯片、药物筛选芯片、蛋白激酶芯片、蛋白质互作芯片等蛋白芯片检测,北检(北京)检测技术研究院按照蛋白芯片检测标准对蛋白芯片进行检测分析,7-15个工作日由北检研究院出具蛋白芯片检测报告。
第三方基因表达谱检测机构北检(北京)检测技术研究院可承接肿瘤组织样本、癌旁组织样本、血液样本、骨髓样本、新鲜冷冻组织、石蜡包埋组织、穿刺活检样本等基因表达谱检测,北检研究院按照基因表达谱检测标准对基因表达谱进行检测分析,7-15个工作日由北检检测出具基因表达谱检测报告。
第三方循环肿瘤细胞检测机构北检(北京)检测技术研究院可进行肺癌循环肿瘤细胞检测、肝癌循环肿瘤细胞检测、胃癌循环肿瘤细胞检测、结直肠癌循环肿瘤细胞检测、乳腺癌循环肿瘤细胞检测、前列腺癌循环肿瘤细胞检测、胰腺癌循环肿瘤细胞检测等循环肿瘤细胞检测,北检研究院可根据循环肿瘤细胞检测标准对循环肿瘤细胞进行多方位的检测,7-15个工作日由北检检测出具循环肿瘤细胞检测报告。
第三方甲基化测序检测机构北检检测可承接全基因组甲基化测序、简化代表性甲基化测序、目标区域甲基化测序、甲基化DNA免疫共沉淀测序、单细胞甲基化测序、甲基化特异性PCR检测、焦磷酸测序甲基化分析等甲基化测序检测,北检研究院按照甲基化测序检测标准对甲基化测序进行检测分析,7-15个工作日由北检(北京)检测技术研究院出具甲基化测序检测报告。
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